MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021081	CTG	2	6	135614	135619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881781
3002	NC_021081	GCT	2	6	135624	135629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881781
3003	NC_021081	AGG	2	6	135651	135656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881781
3004	NC_021081	CAC	2	6	135678	135683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881782
3005	NC_021081	GGC	2	6	135699	135704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881782
3006	NC_021081	TGC	2	6	135732	135737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3007	NC_021081	CTG	2	6	135739	135744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3008	NC_021081	GCTGGG	2	12	135750	135761	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	482881782
3009	NC_021081	GCT	2	6	135765	135770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3010	NC_021081	AGG	2	6	135806	135811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881782
3011	NC_021081	TGC	2	6	135812	135817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3012	NC_021081	CTG	2	6	135823	135828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3013	NC_021081	CAT	2	6	135846	135851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881782
3014	NC_021081	TGG	2	6	135890	135895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881782
3015	NC_021081	GGC	2	6	135918	135923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881782
3016	NC_021081	CGG	3	9	135974	135982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881782
3017	NC_021081	GGC	2	6	135984	135989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881782
3018	NC_021081	TGGTT	2	10	136084	136093	0 %	60 %	40 %	0 %	482881782
3019	NC_021081	TGC	2	6	136115	136120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3020	NC_021081	TGC	2	6	136127	136132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3021	NC_021081	G	7	7	136138	136144	0 %	0 %	100 %	0 %	482881782
3022	NC_021081	GTG	3	9	136177	136185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881782
3023	NC_021081	TGG	2	6	136196	136201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881782
3024	NC_021081	TGC	2	6	136220	136225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3025	NC_021081	GCGG	2	8	136242	136249	0 %	0 %	75 %	25 %	482881782
3026	NC_021081	GCTG	2	8	136305	136312	0 %	25 %	50 %	25 %	482881782
3027	NC_021081	CTC	2	6	136321	136326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881782
3028	NC_021081	T	7	7	136337	136343	0 %	100 %	0 %	0 %	482881782
3029	NC_021081	GCT	2	6	136344	136349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3030	NC_021081	GAG	2	6	136381	136386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881782
3031	NC_021081	CCGC	2	8	136388	136395	0 %	0 %	25 %	75 %	482881782
3032	NC_021081	CTG	2	6	136450	136455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3033	NC_021081	GCG	2	6	136462	136467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881782
3034	NC_021081	CAT	2	6	136482	136487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881782
3035	NC_021081	CGG	2	6	136522	136527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881782
3036	NC_021081	G	6	6	136533	136538	0 %	0 %	100 %	0 %	482881782
3037	NC_021081	G	8	8	136572	136579	0 %	0 %	100 %	0 %	482881782
3038	NC_021081	TGC	3	9	136583	136591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3039	NC_021081	TGG	2	6	136619	136624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881782
3040	NC_021081	CGG	2	6	136628	136633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881782
3041	NC_021081	GCT	2	6	136659	136664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3042	NC_021081	G	7	7	136665	136671	0 %	0 %	100 %	0 %	482881782
3043	NC_021081	CTTT	2	8	136673	136680	0 %	75 %	0 %	25 %	482881782
3044	NC_021081	CTG	2	6	136687	136692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881782
3045	NC_021081	GGC	2	6	136759	136764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881783
3046	NC_021081	TGGC	2	8	136838	136845	0 %	25 %	50 %	25 %	482881783
3047	NC_021081	CTG	2	6	136880	136885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881783
3048	NC_021081	CGG	2	6	137002	137007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881783
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3051	NC_021081	GACCCA	2	12	137119	137130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	482881783
3052	NC_021081	GGC	2	6	137134	137139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881783
3053	NC_021081	CGG	2	6	137150	137155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881783
3054	NC_021081	CGG	2	6	137170	137175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881783
3055	NC_021081	ACCA	2	8	137246	137253	50 %	0 %	0 %	50 %	482881783
3056	NC_021081	CTG	2	6	137288	137293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881783
3057	NC_021081	TGC	2	6	137331	137336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881783
3058	NC_021081	CTG	2	6	137393	137398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881783
3059	NC_021081	CCG	2	6	137412	137417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881783
3060	NC_021081	TGC	2	6	137436	137441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881783
3061	NC_021081	GGTGCA	2	12	137461	137472	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482881783
3062	NC_021081	GACC	2	8	137483	137490	25 %	0 %	25 %	50 %	482881783
3063	NC_021081	GGT	2	6	137491	137496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881783
3064	NC_021081	GGA	2	6	137503	137508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881783
3065	NC_021081	GCT	2	6	137542	137547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881784
3066	NC_021081	TGA	2	6	137577	137582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881784
3067	NC_021081	GC	3	6	137603	137608	0 %	0 %	50 %	50 %	482881784
3068	NC_021081	TA	3	6	137609	137614	50 %	50 %	0 %	0 %	482881784
3069	NC_021081	AGG	2	6	137625	137630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881784
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3071	NC_021081	TGC	2	6	137757	137762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881784
3072	NC_021081	G	6	6	137831	137836	0 %	0 %	100 %	0 %	482881784
3073	NC_021081	AGCC	2	8	137850	137857	25 %	0 %	25 %	50 %	482881784
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3075	NC_021081	GGCC	2	8	138018	138025	0 %	0 %	50 %	50 %	482881785
3076	NC_021081	GT	3	6	138103	138108	0 %	50 %	50 %	0 %	482881785
3077	NC_021081	GCGG	2	8	138213	138220	0 %	0 %	75 %	25 %	482881785
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3081	NC_021081	C	6	6	138346	138351	0 %	0 %	0 %	100 %	482881785
3082	NC_021081	GGC	2	6	138358	138363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881785
3083	NC_021081	GCC	2	6	138388	138393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881785
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3085	NC_021081	GGA	2	6	138447	138452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881785
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3087	NC_021081	AGC	2	6	138510	138515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881785
3088	NC_021081	C	6	6	138599	138604	0 %	0 %	0 %	100 %	482881785
3089	NC_021081	GGT	2	6	138606	138611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881785
3090	NC_021081	GCGCCC	2	12	138661	138672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881785
3091	NC_021081	ACC	2	6	138730	138735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881786
3092	NC_021081	AGC	2	6	138794	138799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881786
3093	NC_021081	GCTG	2	8	138818	138825	0 %	25 %	50 %	25 %	482881786
3094	NC_021081	GCC	2	6	138826	138831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881786
3095	NC_021081	GTG	2	6	138847	138852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881786
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3100	NC_021081	CGG	2	6	139085	139090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881786
3101	NC_021081	GCC	2	6	139091	139096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881786
3102	NC_021081	G	7	7	139114	139120	0 %	0 %	100 %	0 %	482881786
3103	NC_021081	TGC	2	6	139121	139126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881786
3104	NC_021081	TGC	2	6	139133	139138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881786
3105	NC_021081	GCC	2	6	139164	139169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881786
3106	NC_021081	GGT	2	6	139176	139181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881786
3107	NC_021081	G	8	8	139275	139282	0 %	0 %	100 %	0 %	482881787
3108	NC_021081	GCCCAG	3	18	139306	139323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482881787
3109	NC_021081	C	7	7	139416	139422	0 %	0 %	0 %	100 %	482881787
3110	NC_021081	GCA	2	6	139467	139472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881787
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3112	NC_021081	CTG	2	6	139492	139497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881787
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3116	NC_021081	GGC	2	6	139680	139685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881787
3117	NC_021081	AGG	2	6	139703	139708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881787
3118	NC_021081	CTG	2	6	139723	139728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881787
3119	NC_021081	CAAAT	2	10	139747	139756	60 %	20 %	0 %	20 %	482881787
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3121	NC_021081	TGGC	2	8	139800	139807	0 %	25 %	50 %	25 %	482881788
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3489	NC_021081	GCT	2	6	154818	154823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3490	NC_021081	CAG	2	6	154836	154841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3491	NC_021081	CAC	2	6	154866	154871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881804
3492	NC_021081	CTG	2	6	154884	154889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3493	NC_021081	C	6	6	154900	154905	0 %	0 %	0 %	100 %	482881804
3494	NC_021081	GCC	2	6	154951	154956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881804
3495	NC_021081	AGC	3	9	154957	154965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3496	NC_021081	CCCA	2	8	154975	154982	25 %	0 %	0 %	75 %	482881804
3497	NC_021081	C	7	7	155001	155007	0 %	0 %	0 %	100 %	482881804
3498	NC_021081	GGGC	2	8	155013	155020	0 %	0 %	75 %	25 %	482881804
3499	NC_021081	AAGG	2	8	155023	155030	50 %	0 %	50 %	0 %	482881804
3500	NC_021081	CCAGCA	2	12	155045	155056	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	482881804

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